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DATA / SHAPE

DATA

图谱表示

Graph representation

疾病—基因—药物—证据关系图

VISUAL LANGUAGE

知识图谱、关系投影、相似性地图

疾病—基因—药物—证据关系图

CONTENT STATUS机器核验通过REVIEWED2026-07-20SOURCES2 个来源
CONTEXT / PATH

一条数据记录不是终点。沿着这条路径,可以回到方法,也可以继续进入关系和指标。

哪些方法会产生它?

一条记录由哪些字段组成?

EXAMPLE / STRUCTUREGraph representation
PUBLIC RECORD / REFERENCEP04637 / P53_HUMAN向量表示是分析产物,必须保留实体、关系来源和模型版本,不能脱离图谱解释。核验:2026-07-26 · UniProt release 2026_02打开 UniProtKB
LOCAL SNAPSHOTUniProtKB REST JSON869,335 bytes · SHA-256 452B62F11172打开本地快照
字段含义示例
entity被表示的对象或实体disease_12
context实体所在的关系上下文gene / drug
vector用于计算相似度的表示[-0.12, 0.48, …]
confidence关系或表示的可信度0.81
DIMENSIONS

它记录哪些维度?

  • 实体
  • 关系
  • 上下文
  • 向量表示
QUALITY

需要保留什么质量信息?

  • 实体标准化
  • 关系来源
  • 版本记录
  • 可解释性

使用这类数据前要确认什么?

UNITS / 量纲

单位与口径

  • 实体:entity_id
  • 向量:dimensionless
  • 相似度:按模型定义
MISSING / 缺失

缺失值规则

未连接实体、低置信关系和未生成向量要分别标记。

PRIVACY / 隐私

隐私与访问

涉及人群或临床数据时,向量可能保留可识别模式,应进行隐私和泄露风险评估。

从原始记录到可分析结果

层级问题示例边界
原始记录仪器实际留下什么?疾病—基因—药物—证据关系图先检查质量、缺失和批次。
分析特征可以比较什么?实体 · 关系 · 上下文 · 向量表示特征不等于机制或诊断。
研究指标如何形成可定义的测量?单位、范围、时间窗口必须注明样本和适用人群。
SOURCES / EVIDENCE

来源与证据状态

机器核验通过

当前数据形态页是方法与数据的结构化入口;具体数据集、版本和下载地址仍需在来源中心逐条补充。

查看万灵图志的编辑与 AI 自查方法
TRACE / SOURCES

从数据形态回到来源入口

02 SOURCES
01
NCBINational Library of Medicine · 访问日期待补

45 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源
02
UniProtUniProt Consortium · 访问日期待补

12 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

追溯路径只说明“这条内容从哪里来、覆盖了什么”,不自动代表来源支持所有推断。阅读健康与医学内容时,还需同时核对研究人群、时间窗口和限制条件。

FORMATS可用格式

TSV / XML source annotation · derived vector file

METADATA字段字典入口打开官方说明
TERMS许可与访问

向量是二次分析产物,需额外记录模型、参数和来源版本。

CHECKSUM校验摘要

待实际抓取文件后记录