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DATA / SHAPE

DATA

图像数据

Image

二维图像、三维体数据、病理切片

VISUAL LANGUAGE

细胞图谱、分割轮廓、空间关系

二维图像、三维体数据、病理切片

CONTENT STATUS机器核验通过REVIEWED2026-07-20SOURCES2 个来源
CONTEXT / PATH

一条数据记录不是终点。沿着这条路径,可以回到方法,也可以继续进入关系和指标。

哪些方法会产生它?

一条记录由哪些字段组成?

EXAMPLE / STRUCTUREImage
PUBLIC PORTAL / SAMPLE PATH按组织 / 成像或测序项目查询图像或空间记录必须同时查看组织、平台、坐标和标注元数据。核验:2026-07-26 · project-specific release打开 Human Cell Atlas Data Portal
字段含义示例
x / y像素或体素的空间位置x=184, y=92
channel信号、染色或成像通道DAPI / GFP
intensity当前位置的信号强度0–4095
label人工或模型标注结果nucleus
DIMENSIONS

它记录哪些维度?

  • 像素
  • 空间
  • 时间
  • 通道
QUALITY

需要保留什么质量信息?

  • 分辨率
  • 信噪比
  • 标记质量
  • 分割准确度

使用这类数据前要确认什么?

UNITS / 量纲

单位与口径

  • 坐标:pixel / μm
  • 强度:平台定义单位
  • 时间:采集时间点
MISSING / 缺失

缺失值规则

遮挡、未成像区域和分割失败应保留 mask 或质量标签,不宜填充为背景值。

PRIVACY / 隐私

隐私与访问

人体影像或组织图像应遵守去标识化、研究同意和再利用范围。

从原始记录到可分析结果

层级问题示例边界
原始记录仪器实际留下什么?二维图像、三维体数据、病理切片先检查质量、缺失和批次。
分析特征可以比较什么?像素 · 空间 · 时间 · 通道特征不等于机制或诊断。
研究指标如何形成可定义的测量?单位、范围、时间窗口必须注明样本和适用人群。
SOURCES / EVIDENCE

来源与证据状态

机器核验通过

当前数据形态页是方法与数据的结构化入口;具体数据集、版本和下载地址仍需在来源中心逐条补充。

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TRACE / SOURCES

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02 SOURCES
01
Human Cell AtlasHuman Cell Atlas Consortium · 访问日期待补

18 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源
02
WHOWorld Health Organization · 访问日期待补

36 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

追溯路径只说明“这条内容从哪里来、覆盖了什么”,不自动代表来源支持所有推断。阅读健康与医学内容时,还需同时核对研究人群、时间窗口和限制条件。

FORMATS可用格式

project image files · spatial matrix · metadata TSV

METADATA字段字典入口打开官方说明
TERMS许可与访问

图像和空间数据的使用条件以具体项目、组织和授权范围为准。

CHECKSUM校验摘要

待实际抓取文件后记录