DATA / SHAPE

DATA

关系网络

Network

基因调控网络、蛋白质互作网络、代谢通路

VISUAL LANGUAGE

节点—边网络、通路图、关系矩阵

基因调控网络、蛋白质互作网络、代谢通路

CONTENT STATUS机器核验通过REVIEWED2026-07-20SOURCES3 个来源

CONTEXT / PATH

一条数据记录不是终点。沿着这条路径，可以回到方法，也可以继续进入关系和指标。

01 · METHOD

生物信息学分析蛋白质组学

02 · DATA关系网络Network03 · GRAPH数据 → 特征从记录中提取可比较的特征04 · INDEX测量口径单位、范围与不确定性

PRODUCED BY

哪些方法会产生它？

生物信息学分析蛋白质组学系统生物学

FIELDS

一条记录由哪些字段组成？

EXAMPLE / STRUCTURENetwork

PUBLIC RECORD / REFERENCEP04637 / P53_HUMAN人 TP53 蛋白的 Reviewed / Swiss-Prot 记录；关系和功能注释仍需查看具体证据。核验：2026-07-26 · UniProt release 2026_02打开 UniProtKB

LOCAL SNAPSHOTUniProtKB REST JSON869,335 bytes · SHA-256 452B62F11172…打开本地快照

字段含义示例

source关系的起点节点TP53

target关系的终点节点CDKN1A

relation关系的类型或方向regulates

evidence支持关系的证据等级curated / 0.86

DIMENSIONS

它记录哪些维度？

节点
边
方向
证据

QUALITY

需要保留什么质量信息？

关系定义
方向性
证据等级
网络范围

GOVERNANCE

使用这类数据前要确认什么？

UNITS / 量纲

单位与口径

节点：entity_id
边：relation type
证据：evidence level / score

MISSING / 缺失

缺失值规则

未知关系、未评估关系和无证据关系应分开，不应当作负关系。

PRIVACY / 隐私

隐私与访问

公共分子关系通常不含个人信息；涉及人体研究的关联仍需检查来源与授权范围。

INTERPRETATION

从原始记录到可分析结果

层级问题示例边界

原始记录仪器实际留下什么？基因调控网络、蛋白质互作网络、代谢通路先检查质量、缺失和批次。

分析特征可以比较什么？节点 · 边 · 方向 · 证据特征不等于机制或诊断。

研究指标如何形成可定义的测量？单位、范围、时间窗口必须注明样本和适用人群。

RELATIONS

从数据进入下一层

特征原始数据如何成为可分析特征关系特征之间如何形成研究关系指标定义单位、范围和不确定性

SOURCES / EVIDENCE

来源与证据状态

机器核验通过

专业数据库NCBINational Library of Medicine 专业数据库UniProtUniProt Consortium 结构数据库RCSB PDBProtein Data Bank

当前数据形态页是方法与数据的结构化入口；具体数据集、版本和下载地址仍需在来源中心逐条补充。

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TRACE / SOURCES

从数据形态回到来源入口

03 SOURCES

NCBINational Library of Medicine · 访问日期待补

45 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

UniProtUniProt Consortium · 访问日期待补

12 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

RCSB PDBProtein Data Bank · 访问日期待补

5 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

追溯路径只说明“这条内容从哪里来、覆盖了什么”，不自动代表来源支持所有推断。阅读健康与医学内容时，还需同时核对研究人群、时间窗口和限制条件。

FORMATS可用格式

FASTA · XML · TSV · text

METADATA字段字典入口打开官方说明

TERMS许可与访问

UniProt 的下载、版本和再利用应遵循其官方数据说明。

CHECKSUM校验摘要

已记录