需要什么？
- 蛋白质提取物
- 肽段
- 质谱平台
从问题到可读数据
01问题→
02对象→
03方法→
04数据→
05特征→
06关系→
07结果
METHOD / 分子测量
METHOD
蛋白质组学
Proteomics
样本中有哪些蛋白质，它们的丰度、修饰和相互作用如何变化？
输入蛋白质提取物 · 肽段 · 质谱平台输出蛋白鉴定 · 丰度矩阵 · 修饰位点 · 候选通路
RESEARCH PATH
产生什么？
- 蛋白鉴定
- 丰度矩阵
- 修饰位点
- 候选通路
DATA
输出数据如何进入下一层？
方法不是终点。它把样本或观察转化为某种数据形态，数据还需要经过质量控制、分析和指标定义，才能支持可靠解释。
VISUAL
数据可以怎样被看见？
METHOD → DATA蛋白质组学 · 分子测量
01输入蛋白质提取物 · 肽段
02处理实验流程 · 质量控制
03输出蛋白鉴定 · 丰度矩阵
蛋白丰度图、修饰位点图、通路网络。先理解输入与测量边界，再阅读输出数据。
分辨率蛋白质—复合物—通路
先检查什么？
不能直接推出什么？
- 低丰度蛋白可能漏检
- 相对丰度不等于绝对功能
- 通路富集需要明确背景集
OBJECTS
适合研究哪些对象？
SOURCES / EVIDENCE
已找到来源来源与证据状态
方法的来源主要支持方法原理和使用边界；具体实验结果仍需回到原始数据、研究设计和独立验证。
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