DATA / SHAPE

DATA

空间数据

Spatial

细胞邻域、组织区域、生态分布

VISUAL LANGUAGE

空间图谱、网络图、区域分布

细胞邻域、组织区域、生态分布

CONTENT STATUS机器核验通过REVIEWED2026-07-20SOURCES2 个来源

CONTEXT / PATH

一条数据记录不是终点。沿着这条路径，可以回到方法，也可以继续进入关系和指标。

01 · METHOD

空间组学显微镜

02 · DATA空间数据Spatial03 · GRAPH数据 → 特征从记录中提取可比较的特征04 · INDEX测量口径单位、范围与不确定性

PRODUCED BY

哪些方法会产生它？

空间组学显微镜生态观测

FIELDS

一条记录由哪些字段组成？

EXAMPLE / STRUCTURESpatial

PUBLIC PORTAL / SAMPLE PATH按组织区域和空间项目查询空间数据的坐标、尺度、区域和邻域定义必须随数据一起解释。核验：2026-07-26 · project-specific release打开 Human Cell Atlas Data Portal

字段含义示例

x / y / z对象在空间中的坐标12.4 / 8.1 / 0.6

region组织或环境中的区域标签cortex

neighbor相邻对象或局部关系cell_18

scale观察所处的空间尺度single-cell

DIMENSIONS

它记录哪些维度？

坐标
邻近
区域
尺度

QUALITY

需要保留什么质量信息？

定位精度
尺度一致性
组织完整性
空间分辨率

GOVERNANCE

使用这类数据前要确认什么？

UNITS / 量纲

单位与口径

坐标：pixel / μm
距离：μm
区域：项目定义的 ontology

MISSING / 缺失

缺失值规则

无坐标、低定位置信度和未标注区域不能混为同一类缺失。

PRIVACY / 隐私

隐私与访问

空间组织数据可能具有样本来源信息，需遵循项目的去标识化和访问规则。

INTERPRETATION

从原始记录到可分析结果

层级问题示例边界

原始记录仪器实际留下什么？细胞邻域、组织区域、生态分布先检查质量、缺失和批次。

分析特征可以比较什么？坐标 · 邻近 · 区域 · 尺度特征不等于机制或诊断。

研究指标如何形成可定义的测量？单位、范围、时间窗口必须注明样本和适用人群。

RELATIONS

从数据进入下一层

特征原始数据如何成为可分析特征关系特征之间如何形成研究关系指标定义单位、范围和不确定性

SOURCES / EVIDENCE

来源与证据状态

机器核验通过

研究联盟数据库Human Cell AtlasHuman Cell Atlas Consortium 官方健康资料WHOWorld Health Organization

当前数据形态页是方法与数据的结构化入口；具体数据集、版本和下载地址仍需在来源中心逐条补充。

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TRACE / SOURCES

从数据形态回到来源入口

02 SOURCES

Human Cell AtlasHuman Cell Atlas Consortium · 访问日期待补

18 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

WHOWorld Health Organization · 访问日期待补

36 个站内内容节点 · 版本信息待核对

原始来源

追溯路径只说明“这条内容从哪里来、覆盖了什么”，不自动代表来源支持所有推断。阅读健康与医学内容时，还需同时核对研究人群、时间窗口和限制条件。

FORMATS可用格式

project TSV metadata · spatial matrix · coordinate files

METADATA字段字典入口打开官方说明

TERMS许可与访问

空间数据的访问、再利用和人体样本条款以具体项目为准。

CHECKSUM校验摘要

待实际抓取文件后记录