需要什么？
- 组织切片
- 空间探针
- 成像或测序平台
从问题到可读数据
01问题→
02对象→
03方法→
04数据→
05特征→
06关系→
07结果
METHOD / 空间与形态
METHOD
空间组学
Spatial omics
基因或蛋白信号位于组织的什么位置，并与哪些细胞相邻？
输入组织切片 · 空间探针 · 成像或测序平台输出空间表达矩阵 · 组织坐标 · 邻域关系 · 区域标注
RESEARCH PATH
产生什么？
- 空间表达矩阵
- 组织坐标
- 邻域关系
- 区域标注
DATA
输出数据如何进入下一层？
方法不是终点。它把样本或观察转化为某种数据形态，数据还需要经过质量控制、分析和指标定义，才能支持可靠解释。
VISUAL
数据可以怎样被看见？
METHOD → DATA空间组学 · 空间与形态
01输入组织切片 · 空间探针
02处理实验流程 · 质量控制
03输出空间表达矩阵 · 组织坐标
组织切片、空间热图、邻域网络。先理解输入与测量边界，再阅读输出数据。
分辨率分子—细胞—组织空间
先检查什么？
不能直接推出什么？
- 空间分辨率与检测通量需要权衡
- 邻近不代表直接相互作用
- 组织处理会影响信号
OBJECTS
适合研究哪些对象？
SOURCES / EVIDENCE
已找到来源来源与证据状态
方法的来源主要支持方法原理和使用边界；具体实验结果仍需回到原始数据、研究设计和独立验证。
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