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METHOD / 空间与状态

METHOD

单细胞组学

Single-cell omics

一个组织中有哪些细胞类型和细胞状态?

输入单细胞悬液 · 条形码 · 测序文库输出表达矩阵 · 细胞聚类 · 细胞状态 · 谱系线索
CONTENT STATUS机器核验通过REVIEWED2026-07-20SOURCES1 个来源
从单个细胞、空间网格到组织邻域关系的单细胞图谱插图
从单个细胞到组织邻域,数据需要经过定位、聚类和关系解释。

从问题到可读数据

01问题
02对象
03方法
04数据
05特征
06关系
07结果
INPUT

需要什么?

  • 单细胞悬液
  • 条形码
  • 测序文库
OUTPUT

产生什么?

  • 表达矩阵
  • 细胞聚类
  • 细胞状态
  • 谱系线索

输出数据如何进入下一层?

方法不是终点。它把样本或观察转化为某种数据形态,数据还需要经过质量控制、分析和指标定义,才能支持可靠解释。

数据可以怎样被看见?

METHOD → DATA单细胞组学 · 空间与状态
INPUT · PROCESS · OUTPUT · QUALITY01 / INPUT02 / PROCESS03 / OUTPUT样本:单细胞悬液质量控制与分析流程数据:表达矩阵
01输入单细胞悬液 · 条形码
02处理实验流程 · 质量控制
03输出表达矩阵 · 细胞聚类
READING NOTE

降维图、热图、细胞图谱。先理解输入与测量边界,再阅读输出数据。

分辨率单细胞—细胞群体
QUALITY CONTROL

先检查什么?

细胞活性双细胞率测序深度批次校正
LIMITS

不能直接推出什么?

  • 组织解离可能丢失空间信息
  • 聚类不自动等于真实细胞类型
  • 状态解释需要外部证据
SOURCES / EVIDENCE

来源与证据状态

已找到来源

方法的来源主要支持方法原理和使用边界;具体实验结果仍需回到原始数据、研究设计和独立验证。

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