需要什么？
- 环境或宿主样本
- DNA 文库
- 参考数据库
从问题到可读数据
01问题→
02对象→
03方法→
04数据→
05特征→
06关系→
07结果
METHOD / 群落与环境
METHOD
宏基因组学
Metagenomics
如何在不逐一培养的情况下观察微生物群落的组成与功能潜力？
输入环境或宿主样本 · DNA 文库 · 参考数据库输出物种组成 · 功能基因 · 代谢潜力 · 群落差异
RESEARCH PATH
产生什么？
- 物种组成
- 功能基因
- 代谢潜力
- 群落差异
DATA
输出数据如何进入下一层？
方法不是终点。它把样本或观察转化为某种数据形态，数据还需要经过质量控制、分析和指标定义，才能支持可靠解释。
VISUAL
数据可以怎样被看见？
METHOD → DATA宏基因组学 · 群落与环境
01输入环境或宿主样本 · DNA 文库
02处理实验流程 · 质量控制
03输出物种组成 · 功能基因
分类组成图、功能热图、群落网络。先理解输入与测量边界，再阅读输出数据。
分辨率群落—功能基因—环境
先检查什么？
不能直接推出什么？
- 功能潜力不等于实际活性
- 相对丰度不等于绝对数量
- 宿主与环境混杂需要单独处理
OBJECTS
适合研究哪些对象？
SOURCES / EVIDENCE
已找到来源来源与证据状态
方法的来源主要支持方法原理和使用边界；具体实验结果仍需回到原始数据、研究设计和独立验证。
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